CELL//BIOLOGICAL DATA STORAGE SIMULATOR

CELL 是一款开源的生物数据存储模拟器，它利用 Cello 框架将底层 Verilog 代码直接映射到细胞架构中，实现从数字逻辑到生物存储的跨越。其核心创新在于引入了一种反向 CRISPRi 逻辑门系统（通过 dCas9 实现 0=ON/1=OFF），有效规避了代谢负担，使得文本字符串能够被编码为 DNA 位数组。用户可在交互式 2.5D 浏览器界面中，注入化学触发器并实时解码光脉冲流，将数据还原为 ASCII 文本。

核心功能

• Verilog 到 DNA 编译：将硬件描述语言直接转化为生物存储指令，简化设计流程。
• 反向 CRISPRi 逻辑门：采用 dCas9 蛋白实现高效的逻辑运算，降低细胞代谢压力。
• 实时数据解码：通过模拟光脉冲流，将 DNA 数据还原为可读文本，验证存储完整性。
• 交互式可视化：2.5D 界面直观展示细胞内部状态，支持化学触发器的注入与观察。

主要特性

• 开源免费：完全开源，用户可自由修改和扩展。
• 无需安装：基于浏览器运行，即开即用，无需复杂环境配置。
• 教育友好：适合教学演示，帮助理解生物存储与逻辑电路结合的原理。
• 高扩展性：支持自定义 Verilog 模块，便于实验不同编码策略。

适用场景

• 生物信息学研究：探索 DNA 存储的可行性，验证编码算法。
• 教育领域：作为生物计算课程的教学工具，直观展示抽象概念。
• 硬件设计验证：在生物环境中模拟数字电路行为，减少物理实验成本。

总之，CELL 为生物存储与计算领域提供了一个创新且易用的模拟平台，让复杂概念变得触手可及。